Comparatif des solutions de comptabilité en ligne pour indépendants, freelances, TPE et sociétés : logiciels de facturation et experts-comptables en ligne, avec tarif, facturation électronique 2026, comptabilité, paie et intégrations.
La comptabilité en ligne regroupe deux familles : les experts-comptables en ligne (accompagnement humain, tenue des comptes, bilan) et les logiciels de facturation et de gestion (autonomie, automatisation). Le bon choix dépend de votre statut, de votre volume d'activité et de votre besoin de conseil. Notre comparateur évalue le périmètre réel (tenue, déclarations, paie, facturation électronique), le tarif et l'accompagnement. Avec la réforme de la facturation électronique, vérifiez la compatibilité avec une plateforme agréée (PDP).
Classement adapté au statut « Micro-entreprise » — les outils non adaptés sont masqués.
| Score | Solution | Prix /mois | Facture élec. | Compta | Paie | API | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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95
4,7/5 |
Dougs★ Partenaire Expert-comptable en ligne Adapté Micro-entreprise : 92/100 |
29 €–129 €/mois essai : Période d'essai offerte (souvent 1 à 3 mois) |
Plateforme agréée (transmet directement) | ✓ | ✓ | ✓ | |
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74
4,4/5 |
Indy★ Partenaire Logiciel comptabilité + facturation Adapté Micro-entreprise : 85/100 |
Gratuit payant jusqu'à 49 €/mois essai : Gratuit |
Plateforme agréée (transmet directement) | ✓ | ✗ | ✗ | Ouvrir un compte chez Indy →lien partenaire |
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78
4,5/5 |
Pennylane Logiciel facturation + comptabilité Adapté Micro-entreprise : 88/100 |
14 €–79 €/mois essai : Essai 15 jours |
Plateforme agréée (transmet directement) | ✓ | ✓ | ✓ | — |
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72
4,4/5 |
Tiime Logiciel facturation (+ compte pro) Adapté Micro-entreprise : 88/100 |
Gratuit payant jusqu'à 50 €/mois essai : Gratuit |
Plateforme agréée (transmet directement) | ✓ | ✗ | ✗ | — |
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67
4,3/5 |
Abby Logiciel facturation (auto-entrepreneur) Adapté Micro-entreprise : 85/100 |
Gratuit payant jusqu'à 16 €/mois essai : Gratuit |
Plateforme agréée (transmet directement) | ✓ | ✗ | ✗ | — |
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81
4,5/5 |
Clémentine Expert-comptable en ligne Adapté Micro-entreprise : 74/100 |
39 €–199 €/mois essai : Devis ; satisfait ou remboursé |
À raccorder à une plateforme agréée tierce | ✓ | ✓ | ✗ | — |
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51
4,1/5 |
Henrri Logiciel facturation gratuit Adapté Micro-entreprise : 74/100 |
Gratuit essai : Gratuit |
À raccorder à une plateforme agréée tierce | ✗ | ✗ | ✗ | — |
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81
4,5/5 |
Keobiz Expert-comptable en ligne Adapté Micro-entreprise : 73/100 |
69 €–149 €/mois essai : Devis |
À raccorder à une plateforme agréée tierce | ✓ | ✓ | ✗ | — |
L'expert-comptable en ligne convient si vous voulez déléguer (bilan, déclarations, conseil) ; le logiciel convient si vous gérez vous-même la facturation et la saisie. Certains acteurs combinent les deux.
Les experts-comptables en ligne sont inscrits à l'Ordre comme les cabinets traditionnels ; la différence porte sur le mode de relation (à distance, outils numériques) et souvent le tarif.
De plus en plus. Vérifiez que la solution émet des factures au format conforme (Factur-X…) et se connecte à une plateforme agréée. Le détail figure dans chaque fiche.
